Mercado Libre была основана в 1999 году в Аргентине. Основатель и генеральный директор Маркос Гальперин основал компанию во время учебы в Стэнфордском университете. Он получил финансирование от Джона Мьюза, соучредителя HM Capital Partners. Mercado Libre получила дополнительное финансирование от JPMorgan Partners, Flatiron Partners, Goldman Sachs, GE Capital и Banco Santander Central Hispano. В 1999 году Mercado Libre была выбрана в качестве инициативной компании.
По состоянию на 2016 год у Mercado Libre было 174,2 миллиона пользователей в Латинской Америке, что делает его самым популярным сайтом электронной коммерции в регионе по количеству посетителей. Компания осуществляет свою деятельность в Аргентине, Боливии, Бразилии, Чили, Колумбии, Коста-Рике, Доминиканской Республике, Мексике, Испании, Эквадоре, Гватемале, Гондурасе, Перу, Панаме, Уругвае и Венесуэле.
В 2011 году компания перевела свою платформу на технологию с открытым исходным кодом. Переход позволил разработчикам интерфейса прикладного программирования (API) расширить решения и сервисы платформы. В 2013 году Mercado Libre запустила Коммерческий фонд MeLi, предназначенный для инвестирования в технологические стартапы, создающие программное обеспечение с использованием API Mercado Libre. К августу 2016 года фонд инвестировал 1,5 миллиона долларов в 15 компаний в Аргентине, Бразилии и Мексике. Mercado Libre приобрела Portal Inmobiliario, чилийский сайт объявлений, в 2014 году. В 2015 году Mercado Libre объявила о приобретении Metroscúbicos.com портал мексиканской компании по недвижимости Grupo Expansión.
В 2016 году Mercado Libre перенесла свою штаб-квартиру в Бразилии в новые офисы в Сан-Паулу. В комплексе площадью 17 000 квадратных метров, получившем название Melicidade, располагались кафетерий, аудитория, тренажерный зал, салон красоты, залы для совещаний и тренировок, а также зона отдыха.
В 2019 году Mercado Libre открыла свои первые дистрибьюторские центры в Аргентине, Бразилии и Мексике. В марте 2020 года Mercado Libre объявила о своих новых распределительных центрах в Чили и Колумбии. В июне 2020 года Mercado Libre анонсировала свой новый центр программного обеспечения в Колумбии. А в марте 2021 года Mercado Libre объявила об инвестициях в размере 1,8 миллиарда долларов в свои бразильские операции.
На протяжении двух десятилетий с целью содействия экономической и финансовой интеграции и оптимизации взаимодействия с пользователями MercadoLibre, здесь разрабатывают платежные инструменты, логистику, финансирование, рекламу и программные услуги.
Экосистема компании состоит из двух крупных бизнес-единиц: электронной коммерции и финансовых технологий. В этих двух великих мирах, свободном рынке и платном рынке, объединяются различные компании, направленные на улучшение взаимодействия с пользователем: Маркет Доставка, Кредиты, Маркет Магазины, Реклама и VIS.