Аэропорт Джона Уэйна (John Wayne Airport) изначально был частной взлетно-посадочной полосой, построенной в 1920-х годах пионером авиации Эдди Мартином на земле компании Irvine Company. В 1923 году Мартин основал летную школу и Martin Aviation, одну из старейших авиационных компаний страны. Аэропорт Джона Уэйна стал государственным объектом в 1939 году в результате обмена землей между компанией Irvine Company и округом Ориндж. После службы в качестве военной базы во время Второй мировой войны он был возвращен федеральным правительством округу с условием, что он останется открытым для всех видов использования в авиации.
Терминал Эдди Мартина площадью 2 043,87 м² был построен в 1967 году для размещения 400 000 пассажиров в год. Реконструкция добавила две зоны ожидания для пассажиров в 1974 году, новую зону выдачи багажа в 1980 году и здание пристройки терминала в 1982 году, увеличив площадь объекта до 29 000 квадратных футов. 20 июня 1979 года Совет попечителей округа Ориндж переименовал аэропорт округа Ориндж в аэропорт Джона Уэйна в честь покойного актера Джона Уэйна.
В 1985 году округ Ориндж, город Ньюпорт-Бич, рабочая группа аэропорта (AWG) и Stop Polluting Our Newport (SPON) подписали соглашение в Федеральном суде, чтобы формализовать консенсус, достигнутый между округом Ориндж и местными сообществами относительно характера и масштабов улучшений аэропорта, а также определили эксплуатационные и пропускные ограничения этих улучшений. Проект улучшения аэропорта Джона Уэйна был крупнейшим проектом общественных работ в истории округа и включал расширение парковочных мест и строительство терминала Томаса Ф. Райли.
Строительство первой части проекта улучшения аэропорта началось в 1987 году с закладки фундамента для западной части парковочных зон для авиации общего назначения, которые были расположены на месте нового терминала. 16 сентября 1990 г. Терминал Томаса Ф. Райли открыт для публики. Терминал Томаса Ф. Райли был открыт для публики 16 сентября 1990 года. Здание площадью 31 391,94 м² может похвастаться 14 трапами, четырьмя багажными лентами, двумя залами ожидания авиакомпаний и разнообразными точками продажи еды и подарков. Терминал был назван в честь руководителя пятого округа, чья роль в переговорах с общественностью способствовала продвижению проекта по улучшению.
Архитекторы из Leason Pomeroy Associates, Gensler and Associates и Thompson Consultants International спроектировали терминал так, чтобы он напоминал фюзеляж самолета. Терминал был спроектирован так, чтобы его можно было видеть с любой точки обзора на 360 градусов. Среди выдающихся особенностей отделка из натурального камня, нержавеющей стали и 80-футовый стеклянный центральный вестибюль. Общий бюджет всех улучшений составил 310 миллионов долларов. Финансирование проекта по улучшению аэропорта осуществлялось из ряда источников: облигации общего долга, гранты FAA и существующие доходы аэропорта.
В 1994 году был снесен терминал Эдди Мартина. В 1999 году восточная парковка была расширена, чтобы добавить около 2000 мест и центр наземного транспорта. Весь проект стоимостью 28 миллионов долларов был оплачен из резервных фондов. В 2002 году было изменено соглашение об урегулировании 1985 года. Новое соглашение позволяет аэропорту Джона Уэйна увеличить количество пассажиров и ежедневных отправлений, добавить до 6 новых выходов на посадку и дает аэропорту Джона Уэйна гибкость в выделении двух дополнительных ежедневных грузовых рейсов пассажирским перевозчикам на временной основе.