Авиакомпания JetSmart Argentina ведёт свою историю с 2016 года, когда была создана под названием Alas del Sur Líneas Aéreas («Южные крылья»). Первоначальная стратегия компании предусматривала создание базового аэропорта в Кордове и развитие маршрутной сети из этого города. Планировалось, что уже в апреле 2017 года перевозчик начнёт выполнять рейсы по направлениям внутри Южной Америки, а к 2022 году запустит дальнемагистральные маршруты в Северную Америку, Европу и Азию. Для реализации этих планов предполагалось использовать самолёты Airbus A320 и Boeing 777. Однако из-за отсутствия сертификата эксплуатанта начало операционной деятельности было перенесено на неопределённый срок.
В июне 2018 года инвестиционная группа Indigo Partners приобрела авиакомпанию через свою чилийскую дочернюю структуру JetSmart. Благодаря этой сделке бренд JetSmart получил возможность выйти на рынок внутренних авиаперевозок Аргентины, а сама компания была переименована в JetSmart Argentina. В декабре 2018 года перевозчик получил сертификат эксплуатанта и пополнил свой флот первым самолётом Airbus A320-200 с регистрационным номером LV-HEK. Спустя два месяца, в феврале 2019 года, авиакомпания объявила о запуске первых маршрутов и открыла продажу билетов на рейсы, стартовавшие 10 апреля 2019 года. Основной базой стал аэропорт Эль-Паломар, расположенный недалеко от Буэнос-Айреса. Ранее этот аэропорт уже использовался материнской компанией JetSmart для выполнения рейсов из Сантьяго.
Продолжая расширение своей деятельности, в августе 2019 года компания сообщила о намерении открыть в ноябре новое направление в Росарио, а также увеличить численность парка Airbus A320 до шести воздушных судов. После приобретения авиакомпании Norwegian Air Argentina в декабре 2019 года JetSmart Argentina планировала начать выполнение рейсов из аэропорта Аэропарк Хорхе Ньюбери в марте 2020 года. Поскольку аргентинские авиационные власти не сразу согласовали передачу маршрутных прав, связанных с деятельностью Norwegian, её самолёты Boeing 737 продолжили эксплуатацию по схеме лизинга вместе с экипажами и техническим обслуживанием. Для этих операций было создано отдельное подразделение под названием JetSmart Regional.
В дальнейшем развитие проекта осложнилось последствиями пандемии COVID-19, которая серьёзно повлияла на мировую авиационную отрасль. Работа базы в Аэропарке была временно приостановлена, а все действующие рейсы JetSmart Argentina к концу 2020 года были переведены из аэропорта Эль-Паломар в международный аэропорт Эсейса. В начале 2021 года появились сообщения о том, что авиакомпания окончательно откажется от возвращения в Эль-Паломар и сосредоточит свою деятельность в Аэропарке.
